Всероссийская научная конференция «История Церкви: факт и мысль» – основная конференция Московской духовной академии исторической тематики. Она проводится на регулярной основе ежегодно.

Организацией и проведением конференции занимается Кафедра Церковной истории. Организационный комитет конференции утверждается приказом ректора МДА. Его состав ежегодно обновляется. Председателем оргкомитета является по должности заведующий Кафедрой Церковной истории.

С содержательной точки зрения «История Церкви: факт и мысль» – конференция политематическая. Такая стратегия избрана для того, чтобы преподавательская корпорация и учащиеся исследователи Кафедры Церковной истории МДА имели регулярную площадку для обсуждения в компетентном сообществе своих изысканий самого широкого спектра. Также ежегодно для конференции избирается специальная тема. Как правило, спецтема соответствует основному церковному юбилею текущего года (в 2020 году это было 95-летие преставления святителя Тихона, Патриарха Московского, а в 2021 – 800-летие со дня рождения св. благоверного вел. кн. Александра Невского). Как правило, юбилейное событие определяет тематику пленарного заседания конференции; секции же посвящены самым разным историческим областям: от вопросов истории Древней Церкви до проблем экуменического взаимодействия в новейшей истории. Для участия в конференции приглашаются авторитетные исследователи и молодые ученые, доброй традицией стало участие научных сотрудников Сергиево-Посадского государственного историко-художественного музея-заповедника. Особо ценно, что в этой постепенно складывающейся научной среде студенты исторического профиля магистратуры и аспиранты Кафедры Церковной истории МДА могут делать свои первые самостоятельные шаги, апробировать свои исследования. Оргкомитет с удовольствие предоставляет такую возможность и учащимся других высших учебных заведений.

Доклады участников конференции публикуются в научном журнале Московской духовной академии «Церковный историк». Конференция проходит в Сергиевом Посаде, в помещениях Московской духовной академии; как правило используются Большой актовый зал, Елисаветинский зал Царских чертогов и аудитории бакалаврского корпуса. Для всех докладчиков оргкомитет изготавливает сертификаты участника.

Конференция проводится регулярно, начиная с 2019 года.